Sergio Agüero je svoju profesionalnu karijeru započeo u julu 2003., kad je sa samo 15 godina i 13 dana debitirao za Independiente. Sergio se 2006. pridružio španskom velikanu Atlético Madridu. Za njih je nastupio 234 puta i dao 101 gol, od čega su mnogi bili u ključnim trenucima – npr. 2008., nakon čega se klub kvalifikovao u UEFA Ligu prvaka prvi put nakon deset godina.
Sezona 2009./2010. bila je još uspješnija. Atlético Madrid je osvojio UEFA Europsku ligu, UEFA Superkup i pretrpio poraz tijesnim rezultatom od Seville u finalu Kupa kralja.
Sergio je 2011. prešao u engleski klub, Manchester City, za 38 miliona eura. Bio je to jedan od najskupljih transfera u istoriji Premier lige. Agüero nije razočarao. U svojem debiju protiv Swansea Cityja ušao je s klupe i dao dva gola.
U posljednjoj utakmici sezone Premier lige 2012., Agüero je pogotkom protiv momčadi Queens Park Rangers u 94. minuti Manchester Cityju donio prvi naslov prvaka u 44 godine i velikim se slovima upisao u istoriju kluba.
Sa Manchester Cityjem osvojio je i naslov prvaka 2013./2014. te Zlatnu kopačku u sezoni 2015. Prošle je sezone Agüero sa Manchester Cityjem nastupio u polufinalu Lige prvaka te su nakon poraza od Real Madrida rezultatom 1-0 ispali iz daljeg takmičenja. U svojoj reprezentativnoj karijeri sa Argentinom, osvojio je zlatnu olimpijsku medalju 2008., srebrnu medalju na svjetskom prvenstvu 2014. te srebrne medalje na turniru Copa América 2015. i 2016.