U Parku prirode Hutovo blato identificirano je 18 endemskih biljnih vrsta iz 9 porodica i 38 ugroženih biljnih vrsta iz 22 porodice, prema projektu “Praćenje stanja i kartiranje zona mrijestilišta endemskih vrsta riba”. Vegetacijski pokrov obuhvaća različite zajednice, uključujući termofilne šume hrasta medunca i bjelog graba, poplavne ravničarske i močvarne zajednice te vodene površine s lopočem i loknjem.
Najveće površinsko učešće u Hutovom blatu imaju vodene površine (34,3%) i tršćaci (14,8%), dok slobodne vodene površine čine oko 30,6%. Tršćaci su ključni za mrijest riba, jer pružaju važno stanište za razvoj mlađi riba. Rezultati istraživanja bit će uključeni u GIS bazu podataka za definiranje zona značajnih za mrijest endemskih riba. Projekt se sufinancira s 79.000 KM od Fonda za zaštitu okoliša FBiH i 21.000 KM od CIRP-a.
